Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELLSQ9NRZ9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HELLSQ9NRZ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms