Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHPT1Q9NRX4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHPT1Q9NRX4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms