Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms