Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB6BQ9NRW1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB6BQ9NRW1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms