Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
DUOX2Q9NRD8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms