Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPTBN5Q9NRC6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTBN5Q9NRC6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms