Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAR1AQ9NR31 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAR1AQ9NR31 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms