Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRDM10Q9NQV6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRDM10Q9NQV6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM10Q9NQV6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM10Q9NQV6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM10Q9NQV6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM10Q9NQV6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM10Q9NQV6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM10Q9NQV6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM10Q9NQV6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM10Q9NQV6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM10Q9NQV6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms