Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNB1IP1Q9NPC3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNB1IP1Q9NPC3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms