Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB9BQ9NP90 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB9BQ9NP90 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms