Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4F12Q9HCS2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4F12Q9HCS2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms