Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNRC6CQ9HCJ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNRC6CQ9HCJ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TNRC6CQ9HCJ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms