Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms