Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms