Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LY9Q9HBG7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LY9Q9HBG7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms