Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RABEP2Q9H5N1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABEP2Q9H5N1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms