Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms