Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX4Q9H1E5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMX4Q9H1E5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms