Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDCBP2Q9H190 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDCBP2Q9H190 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms