Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIL1Q9H173 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIL1Q9H173 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms