Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXD1Q9GZZ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD1Q9GZZ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms