Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NYXQ9GZU5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NYXQ9GZU5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms