Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIF3L1Q9GZT8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms