Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZYG11BQ9C0D3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZYG11BQ9C0D3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms