Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NLRP1Q9C000 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NLRP1Q9C000 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms