Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTPBP4Q9BZE4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTPBP4Q9BZE4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms