Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A5Q9BY07 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A5Q9BY07 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC4A5Q9BY07 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms