Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms