Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC94Q9BW85 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC94Q9BW85 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms