Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT61BQ9BVS5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRMT61BQ9BVS5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms