Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KIFC3Q9BVG8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIFC3Q9BVG8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIFC3Q9BVG8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KIFC3Q9BVG8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIFC3Q9BVG8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIFC3Q9BVG8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIFC3Q9BVG8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms