Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM109Q9BVC6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM109Q9BVC6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms