Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFHD1Q9BUP0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms