Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PRADC1Q9BSG0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRADC1Q9BSG0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms