Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD2Q9BSE4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD2Q9BSE4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms