Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP1

PDCD2L, Programmed cell death protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2LQ9BRP1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD2LQ9BRP1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD2LQ9BRP1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD2LQ9BRP1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms