Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BPIFA3Q9BQP9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BPIFA3Q9BQP9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms