Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGIP1Q9BQI5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGIP1Q9BQI5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms