Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPOCK3Q9BQ16 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPOCK3Q9BQ16 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms