Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP5SQ99766 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5SQ99766 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms