Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYSTQ99698 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LYSTQ99698 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms