Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POP1Q99575 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POP1Q99575 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POP1Q99575 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POP1Q99575 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POP1Q99575 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POP1Q99575 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POP1Q99575 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP1Q99575 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP1Q99575 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP1Q99575 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP1Q99575 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP1Q99575 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP1Q99575 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP1Q99575 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POP1Q99575 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP1Q99575 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POP1Q99575 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POP1Q99575 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POP1Q99575 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POP1Q99575 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP1Q99575 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP1Q99575 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP1Q99575 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP1Q99575 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP1Q99575 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP1Q99575 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POP1Q99575 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POP1Q99575 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP1Q99575 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP1Q99575 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP1Q99575 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP1Q99575 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POP1Q99575 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP1Q99575 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP1Q99575 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP1Q99575 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP1Q99575 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POP1Q99575 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP1Q99575 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP1Q99575 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP1Q99575 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP1Q99575 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP1Q99575 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP1Q99575 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POP1Q99575 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms