Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPXM1Q96SM3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms