Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMKK2Q96RR4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMKK2Q96RR4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms