Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMG1Q96Q15 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
SMG1Q96Q15 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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