Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIPOR3Q96MK2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPOR3Q96MK2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms