Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SENP8Q96LD8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SENP8Q96LD8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SENP8Q96LD8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP8Q96LD8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP8Q96LD8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP8Q96LD8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP8Q96LD8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP8Q96LD8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SENP8Q96LD8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms