Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP3Q96KP6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP3Q96KP6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP3Q96KP6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms