Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPGRIP1Q96KN7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPGRIP1Q96KN7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms