Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABS1Q96KC9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms